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四川花椒苗基地分析全国花椒种源的遗传因素
来源:Chinese websites 发布时间:2019年06月11日

      四川花椒苗基地在转录组的数据开发出了11对多态性较高的SSR引物,用11对引物可明确区分花椒与竹叶花椒,也可以区分不同的品种,花椒苗的遗传多样性水平较高于竹叶花椒。

四川花椒苗基地

 

      花椒种源中,河南高庙乡种源(GMXHJ)的遗传多样性水平最(He=0.521),而竹叶花椒苗种源中,四川资中种源(ZZZYJ)的遗传多样性水平最高(He=0.277)。

 

四川花椒苗


       四川花椒苗在长期的栽培过程中经历了瓶颈效应,而竹叶花椒没有经历瓶颈效应;秦岭山脉阻隔了岭南和岭北花椒种源的基因流,形成了南、北种源独特的遗传结构,将花椒以秦岭为界分为了“南椒”和“北椒”两类,竹叶花椒单独为一类。目前栽培的“青花椒”和“顶坛花椒”应归属于竹叶花椒而不是植物学分类上的青花椒。

 

 

      在秦岭地区(陕西和甘肃),由于岭北的花椒苗种源向岭南的渗入,形成了花椒苗种源的过渡地,使得分布于秦岭南麓凤县、秦安、武都等地的花椒种源中也能够检测到岭北种源的遗传物质。

 

 

       花椒和竹叶花椒种源具有高度的遗传分化水平(Fst=0.3961和0.2156)。花椒苗和竹叶花椒的遗传变异主要存在于个体内和群体间。花椒种源的遗传距离与地理距离存在显著相关性(P<0.05),符合距离隔离模式(Isolation ByDistance,IBD),这种 IBD 效应是由岭南群体之间和岭北群体之间的IBD 效应所贡献的,若只考虑岭南群体到岭北群体成对之间的地理距离和遗传距离的相关性,则不显著(r2<0.001,p>0.1),进一步表明秦岭对基因流产生了阻隔作用。

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